La suite di strumenti che porta lo standard ISO/IEC 23092 nel tuo flusso di lavoro genomico — converti, comprimi ed elabora FASTQ / BAM / CRAM / MPEG‑G con un'unica sintassi, con interoperabilità dal sequenziatore alla clinica integrata.
La suite di strumenti consolida i dati di sequenziamento grezzi e allineati, gli assembly del genoma e i metadati in un unico file altamente compresso — e si integra con il modulo di analisi secondaria di GenomSys per semplificare compressione, caricamento ed elaborazione.
Un BAM whole-genome completo NovaSeq 6000 (~76 GB), con tutti i campi ausiliari, viene transcodificato senza perdita di dati a ≈6× (~83% in meno) — fino a ~90% (~10×) su dati più leggeri, e 2,2× più veloce con l'ultimo transcodificatore.
Raggiungi qualsiasi intervallo genomico in meno di un secondo senza decomprimere l'intero file. ≥89% di tempo di accesso in meno rispetto ai formati tradizionali.
Round-trip FASTQ ⇆ BAM ⇆ CRAM ⇆ MPEG‑G senza alcuna perdita di dati. Inseriscilo nelle pipeline esistenti senza riscrivere nulla.
Read, allineamenti, reference e metadati risiedono tutti nello stesso file con piena integrità dei dati — niente più coordinamento tra più file.
Cifratura nativa, metadati di audit-trail e controllo degli accessi preciso basato sui ruoli — la sicurezza è integrata nel formato, non aggiunta a posteriori.
Collegati direttamente all'output del sequenziatore. Salta la fase di preprocessing che un tempo bloccava ogni pipeline clinica.
Disponibile come strumento a riga di comando e come libreria programmatica. La console mostrata in home page è un'anteprima fedele — ogni comando lì mostrato è una reale operazione della suite di strumenti.
mpegg compress sample.fastq.gz
Conversione senza perdita di dati in MPEG‑G con avanzamento e un report delle dimensioni per ogni file.
mpegg transcode --to bam sample.mgb
FASTQ / BAM / CRAM / MPEG‑G bidirezionale — si adatta alle pipeline esistenti.
mpegg access --region chr17:43044295-43125483
Accesso casuale in meno di un secondo a qualsiasi intervallo, senza dover decomprimere l'intero file.
Funziona su Linux e Windows. Acquisisce ogni formato genomico comune. Produce file MPEG‑G che gli strumenti a valle (GVD, Hemotyper, le tue pipeline interne) possono leggere nativamente.
x86_64 e ARM64. Compatibile con i container. Compatibile con le principali distro bioinformatiche (Ubuntu, RHEL, Debian).
Win10 / Win11 (64-bit). Stessa interfaccia CLI della build Linux.
FASTQ (grezzo + gzipped), BAM, CRAM, SAM, MPEG‑G. Read group e header preservati durante la transcodifica.
MPEG‑G (nativo), BAM, CRAM, FASTQ. Le chiamate di varianti vengono esportate in VCF tramite il modulo di analisi secondaria di GenomSys.
Ingegneri bioinformatici, IT di laboratorio, fornitori di servizi di sequenziamento e team di pipeline cliniche — chiunque paghi il costo di archiviazione / trasferimento / rielaborazione imposto dai formati tradizionali.
Comprimi alla fonte. Consegna MPEG‑G ai clienti e abbatti sia i costi di archiviazione sia quelli di banda.
Riduci i tempi di refertazione. L'acquisizione diretta dal sequenziatore elimina il collo di bottiglia del preprocessing prima del variant calling.
Inseriscili nei flussi di lavoro Snakemake / Nextflow. La transcodifica senza perdita di dati significa che non devi migrare tutto in una volta.
Standardizza il formato tra i centri. ISO/IEC 23092 è l'unico standard internazionale aperto per i dati genomici — interoperabilità senza lock-in.